hong-lin-chan
红菱Chan博士
医学教授
  • 生物信息学与结构生物学研究所
    国立清华大学
    台湾新竹市
    电话:03 - 5742476
    电子邮件:hlchan@life.nthu.edu.tw

教育

2001 - 2005 生物化学术和分子生物学中的博士学位 英国伦敦大学大学学院
1994-1996 生命科学理学硕士 国立清华大学,台湾

鸿林议员是全国青花大学(台湾)负责人,用于定量蛋白质组学集团,在蛋白质组学方法开发和应用中拥有10年的经验。他于2005年获得伦敦大学大学学院的博士学位。在沃尔夫森生物医学科学研究所博士后培训后2年后,他从台湾国家清华大学培养了目前的教授。他的小组在使用质谱和其他方法的制备,分离和定量蛋白质和翻译后修饰的专业知识。陈博士是2D-Dige技术的第一个用户之一,通常用于蛋白质表达分析,该组还建立了进行定量磷蛋白酶和氧化还原蛋白质组学分析的平台。他的小组专注于:血清生物标志物发现,表征细胞模型中的氧化还原和紫外线应激反应,细胞信号传导机制,基于乳腺癌,前列腺癌和耐药性的研究。方法包括细胞生物学设施,2D-Dige / MS和定量的2D-LC-MS / MS表达分析。

研究兴趣

肿瘤信号、质谱、细胞器蛋白质组学、肿瘤标志物发现、药物蛋白质组学、转化医学(血清蛋白质组学;(体液蛋白质组学)、微生物群分析、干细胞蛋白质组学、血清生物标志物发现、细胞模型中氧化还原应激反应的特征、细胞信号转导机制,以及基于蛋白质组学的乳腺癌、前列腺癌和耐药性形成研究。


科学活动

教学经验
2014年至今 台湾全国青华大学生物信息与结构生物学教授
2011 - 2014 台湾国立清华大学生物信息与结构生物学副教授
2007 - 2011 台湾国家青花大学助理教授,研究所生物信息学与结构生物学
荣誉和奖励
  • 海外研究奖学金(ORS)
  • 伦敦大学学院研究生研究奖学金
  • 指导研究生陈一军获沈大琛基金优秀研究论文奖
  • 张若凡,生物科学系学生,获102年国家科学基金资助大学生科研项目
  • 指南研究生黄惠图参加两岸清华研究生学术论坛优秀论文奖
  • 指导研究生罗静一获沈大凡基金会优秀研究论文奖
  • 陈静一导师获沈大方基金会优秀研究论文奖
  • 导师李敏研究生获沈达斯汀基金优秀研究论文奖
  • 张若凡,大学指导学生,获得沈大富基金会杰出研究论文奖
  • 获卫生部优秀部友奖
  • 指导研究生赖子佳获生命科学学院第六届海报大赛一等奖
  • 清华大学教师99年学术卓越奖
  • 国家青春大学阿斯蒂学院新教师研究奖
  • 指导研究生赖子嘉、陈毅杰分别获得第七届教学大纲学院优秀作品奖
  • 研究生陆英杰获得第八届中科院海报大赛冠军
  • 国家青春大学阿斯蒂学院新教师研究奖
  • 优秀学术研究成果发表奖
  • 指导博士生研究生Linsing Ting赢得了2012年科学院最佳海报比赛
  • 年度学术优秀奖101个案例
  • 国立清华大学新人才研究奖
  • 优秀学术研究成果发表奖
  • 国立清华大学生命科学学院优秀教学奖
  • 102年学术优秀奖案例
  • 指导博士生研究生Linsing Ting赢得了2013年生物医学工程研究所的论文比赛
  • 博士生导师陈一军获得2013年中国科学院系统学优胜奖
  • 陈景燕是一位大师研究生导师,赢得了中国科学院最佳的海报竞赛2013年
  • 指导博士生Ting Linsing荣获2013年中科院最佳海报大赛
  • 研究生陈静怡荣获2014年生物医学工程学院最佳海报大赛
  • 陈国光硕士研究生项目获得2014年学院论文大赛
  • 导师罗景涛荣获2013年度最佳海报大赛
  • 生物科学系生物系主任张若凡在2014年中国社科院海报大赛中获得特等奖
  • 国立清华大学为吸引和留住特殊人才实行灵活的薪酬和补贴奖励

出版物

  1. 贾伟阮,锡·锡·锡·锡藤,蔡婷蔡,成钦郭,洪林婵,玉驰廖,谭潭,程元康(2016)双特异性磷酸酶6缺乏调节肠道微生物组和转录组对小鼠饮食肥胖症的反应。自然微生物学。在出版社。
  2. Ching-Hsiang Fan,Chien-Yu Ting,Chung-Yin Lin,Hong-Lin Chan,Yuan-Chih Chang,You-Yin Chen,Hao-Li Liu,Chih-Kuang Yeh(2016)非侵入性,有针对性,非病毒Ultrasound-Mediated Gene Delivery for Parkinson’s Disease Treatment. Scientific Reports. In press.
  3. 周秀川,陈景怡,林代英,温月峰,林启辰,林生浩,林庆雄,钟廷文,廖恩志,陈英仁,魏玉珊,蔡义庭,陈洪林*(2016)培美曲美耐药人肺腺癌中上调和下调蛋白的鉴定:黄素还原酶和calreticulin在培美曲霉相关耐药发生中起关键作用。j .蛋白质组研究。在出版社。
  4. Chi-Chen林、陈Jing-Ting孟威Lin Chia-Hao Chan Yueh-Feng温家宝,Shin-Bei Wu Ting-Wen涌、凯文·w·律Hsiu-Chuan周和红菱陈*(2015)识别的蛋白质表达改变gefitinib-resistant人类肺腺癌:资金和mPR gefitinib-associated阻力的发展中起着关键作用。毒理学及应用药理学。在出版社。
  5. Liu Ming-Kun Liu, Jie-Zue Lin, Tzyy-Rong Jinn, Hong-Lin Chan*, tzong-yuan Wu * (2015) Rhopalosiphum padi病毒5'非翻译区序列的鉴定。国际分子科学杂志。在出版社。
  6. 易文罗,林林,盛居昌,嘉浩陈,凯文W.Lyu,乔凡昌,尤金王某才能,戴英林,徐海钊和洪林陈*(2015)具有SiRNA敲低的线粒体蛋白质组学,揭示了抗多柔比蛋白抗子宫癌的ACAT1和MDH2。细胞和分子医学杂志。在出版社。
  7. Szu-Ting Lin,Eugenie Wong May May,Jo-Fan Chang,Ren-yu Hu,Hong-Lin Chan *(2015)PGRMC1有助于在子宫肉瘤中的多柔比星诱导的化学诱导。细胞和分子生命科学。在出版社。
  8. 陈玉国,王新杰,何志堂,李世明,陈鸿霖,钟廷文,谭国堂,李义荣,林志辰。(2015) 5-去甲基诺皮素在人肺癌中促进聚合微管蛋白的形成,导致G2/M期阻滞,并通过JNK激活诱导自噬。营养生物化学杂志。在出版社。
  9. 钟润,谭克,陈HL,莱米,日元MC,李YR,林S,林CC。(2014)吲哚胺2,3-二氧合酶(IDO)酶活性的诱导有助于干扰素-γ诱导的人非小细胞肺癌细胞中的凋亡和死亡受体5。亚太地区癌症预防杂志。在出版社。
  10. 黄慧菊,林启辰,周秀川,陈怡文,林思婷,林怡杰,林代英,Kevin W. Lyu and Hong-Lin Chan*(2014)大黄酸诱导细胞毒性的蛋白质组学分析:内质网应激介导乳腺癌细胞死亡。分子生物系统。在出版社。
  11. Eugenie黄可能不久,Szu-Ting Lin Chi-Chen Lin Jo-Fan Chang埃里克•挂怡文Lo Li-Hsun Lin Ren-Yu Hu Chi-Lun冯,Dai-Ying Lin Shine-Bei Wu Wen-Chi李,凯文·w·律Hsiu-Chuan周和红菱陈*(2014)的识别,在doxorubicin-resistant子宫癌症细胞和抑制蛋白质:网织localbin-1在阿霉素相关耐药的发展中起关键作用。药理研究。在出版社。
  12. 庄景静,戴元昌,林永伦,陈杨一,林伟汉,陈洪林,刘怡文。谷胱甘肽的下调作用年代-转移酶M1蛋白N丁-N-(4-羟基丁基)亚硝胺诱导小鼠膀胱癌变。毒理学及应用药理学。在出版社。
  13. 粉丝涂,嘉文 - 哈哈廖,冯凌阳,仁王林,洪林禅*和西辉吴(2014)LON蛋白酶影响RDXA硝化酶活性和甲硝唑易感性幽门螺杆菌.幽灵。在出版社。
  14. 张卓凡,林思婷,洪耀玲,吕宜玲*(2014)核蛋白质组学与XRCC3敲除揭示阿霉素耐药子宫癌的发展。毒理学杂志。39(2),396-406。
  15. Lin Li-Hsun, sheng - jyh Chang, Ren-Yu Hu, Meng-Wei Lin, Szu-Ting Lin,顺宏Huang, ping - jiang yu, Hsiu-Chuan Chou, Zih-Yin Lai, yong - jen chug - jen and Hong-Lin Chan*(2014)神经内分泌子宫颈癌的生物标志物发现。电泳。35岁,2039 - 2045。
  16. (in chinese)禽呼肠病毒S1133株感染东风-1鸡成纤维细胞的蛋白质组学分析PLoS ONE。9 (3), e92154。
  17. 陈洪林*(2014)5-甲氧基色氨酸对心肌细胞缺血再灌注损伤的保护作用。生物化学与生物物理档案543,15-22。
  18. 陈洪林* (2014)uvb诱导的氧化应激对谷胱甘肽还原酶敲低的影响。蛋白质组学。12(1),2。
  19. Fan Chiao-Yuan, xiu - chuan Chou, Yi-Wen Wen, yuh - feng Wen, Yi-Chih Tsai, Haimei Huang and Hong-Lin Chan* (2013) human lung cancer cells中谷胱甘肽还原酶作用的蛋白质组学和氧化还原-蛋白质组学研究。电泳。34岁,3305 - 3314。
  20. 陈景怡,陈友萱,陈洪林*(2013)高糖诱导的肝细胞蛋白质组改变及其与糖尿病性肝病的相关性。营养生物化学杂志。24,1889-1910。
  21. 李继敏,周秀传,王淑汉,吴杰林,陈宜文,林思婷,陈玉华,陈洪林*(2013)透明质酸对uvb损伤的角膜细胞的保护作用。环境与分子突变。54,429 -449。
  22. 林思婷,罗懿文,张成玉,王文清,张大志,吕平江,陈宜文,周秀川,陈洪林*(2013)抗阿霉素诱导的子宫癌thiol活性改变的氧化还原蛋白组学分析。医药与生物医学分析杂志78-79,1-8。
  23. 叶文陈,徐川钊,林林,汉轩陈,洪林陈*(2013)槲皮素在缺血/再灌注损伤下心肌细胞的心脏保护作用。基于证据的互补和替代医学。2013,364519。
  24. 林林,徐川围,义文陈和洪林陈*。(2013)氧化铈 - 甲霉素诱导的心肌细胞改变硫醇活性的蛋白质组态分析。分子生物系统。9,447-456。
  25. 天仁李,鹤炎,顺炎黄,洪汉陈,洪林陈*和平蒋莉。(2013)对比蛋白质组学分析正常和记忆缺乏果蝇马拉替者头。动物学研究。52,10。
  26. Chieh-Lin Wu,Hsiu-Chuan Chou,Ji-min李,陈陈,陈建,玉华和洪林陈*(2013)透明质-依赖的保护,以对抗碱烧伤的人类角膜细胞。电泳。33岁的1 - 9。
  27. 春亮林林林,浙江春,义文辰,惠万林,涌亮桐,高龙,益居陈,盈雷·李和洪林陈*(2013)口腔鳞状细胞癌等离子体生物标志物的基于蛋白质组学的鉴定。作者:王莹,中国药物与生物医学分析杂志CHINESE。75,7-17。
  28. Chieh-Hsiang Lu,Szu-Ting Lin,Hsiu-Chuan Chou,Ying-Ray Lee和Hong-Lin Chan *(2013)糖尿病患者视网膜病相关血浆生物标志物的蛋白质组学分析。生物化学和生物物理学档案。529,146-156。
  29. 清华法,吉敏李,徐川钊,玉华陈和洪林陈*(2013)H9C2心肌细胞透明质酸依赖性保护:心脏缺血再灌注损伤和治疗细胞模型。毒理学。303,54-71。
  30. Chih-Ping Chen,Tzu-Chia Lai,Schu-Rern Chern,Sheng-Hsiang Li,Hsiu-Chuan Chou,Yi-Wen Chen,Szu-Ting Lin,Ying-Chieh Lu,Chieh-Lin Wu和Hong-Lin Chan *(2013)羊水中雄性和雌性胎儿细胞之间的蛋白质组差异。组学:综合生物学杂志17日,第16 - 26页
  31. 莹瑞李,陈明,明芝蔡,春川钊和洪林陈*(2012)膀胱移行细胞癌等离子体生物标志物的氧化还原及表达蛋白质组学分析。分子生物系统。8, 3314 - 3324。
  32. You-Hsuan Chen,Jing-yi Chen,Yi-Wen Chen,Szu-Ting Lin和Hong-Lin Chan *(2012)高葡萄糖诱导的视网膜色素上皮细胞蛋白质组改变及其与糖尿病视网膜病变的可能相关性。分子生物系统。8, 3107 - 3124。
  33. 陈洪林*(2012)靶向蛋白质组学研究转移相关线粒体蛋白。生物能量学与生物膜杂志。44(6), 629 - 634。
  34. 林思婷,周秀川,张盛哲,陈奕文,吕平江,王文清,玛格丽特Dah-Tsyr常和洪林陈*(2012)蛋白质组学分析负责人子宫癌细胞中的多柔比蛋白抗性抗性的蛋白质。蛋白质组学杂志》上。75(18)5822-5846。
  35. 陈友萱,周秀川,林思婷,陈怡文,罗怡文,陈洪林*(2012)高糖对视网膜色素上皮细胞分泌蛋白组的影响:可能与临床糖尿病视网膜病变相关。蛋白质组学杂志》上。77(1) 111 - 128。
  36. 陈景怡,陈洪林,周秀川(2012)槲皮素诱导的心脏保护作用的蛋白质组学分析。基因组,生物标志物和健康科学。4、。51号~ 53号
  37. 李春林,洪林陈,富川钊(2012)DNA依赖性蛋白激酶受管制素诱导的细胞毒性的胶质母细胞瘤生存。基因组,生物标志物和健康科学。4,54-56。
  38. 易文罗,洪林陈,富川川钊(2012)抗大木素蛋白癌细胞线粒体蛋白的蛋白质组学分析。基因组,生物标志物和健康科学。4,57-60。
  39. 陈志平,陈友萱,Schu-Rern Chern, Shing-Jyh Chang, Te-Lung Tsai, shengxiang Li, Hsiu-Chuan Chou, Yi-Wen Lo, Ping-Chiang Lyu and Hong-Lin Chan*(2012)胎盘蛋白质组分析在唐氏综合征妊娠中的生物标志物发现。分子生物系统。8, 2360 - 2372。
  40. 陈嘉庆,吕颖杰,陈怡文,李文丽,吕杰祥,陈友萱,李云清,林思婷,John F. Timms,李颖雷,周秀全,陈洪林*(2012)1型糖尿病患者血浆中血红蛋白上调:葡萄糖诱导ROS的作用。蛋白质组学杂志》上。75(12),3760-3777。
  41. 陈新子,李天仁,黄顺宏,李晓云,桑子康,陈洪林*,吕炳江(2012)果蝇IBMPFD模型的蛋白质组学分析揭示潜在的致病机制。分子生物系统。八(6),1730 - 1741
  42. 天仁李,顺宏黄,志清辉,鹤炎李,洪春,林林,洪林陈*,平清Lyu *(2012)果蝇Melanogaster的蛋白质组参考地图头。蛋白质组学。12 (11), 1875 - 1878
  43. 鹤川钊,莹千禄,赵胜成,义文陈,平清澜,程文林,约翰F.TIMMS和洪林陈*(2012)蛋白质组学和氧化氢杂志分析Berberine诱导乳腺癌细胞中的细胞毒性。蛋白质组学杂志》上。75(11)3158-3176。
  44. 陈洪霖*,辛克莱J, Timms JF。(2012)利用半胱氨酸标记2D DIGE对氧化还原依赖变化的蛋白质组学分析。方法分子生物学854 113-128。
  45. 吴杰林,周秀川,程超生,李继敏,林思婷,陈义文,陈洪林*(2012)利用赖氨酸和半胱氨酸标记二维差异凝胶电泳分析uvb诱导的皮肤成纤维细胞蛋白表达和氧化还原依赖的变化。蛋白质组学杂志》上。75 (7) 1991 - 2014
  46. 林兆波,陈奕文,刘文新,周秀川,张怡平,林思婷,李继敏,Jian Shiou-Fen, Ying-Ray Lee and Hong-Lin Chan*(2012)子宫肌瘤血浆生物标志物的蛋白质组学鉴定。分子生物系统八(4)1136 - 1145
  47. 张庆耀*,陈鸿霖*,林慧怡,宗德道,高明清,宋明章,林英菊,林成文。(2012)大黄酸诱导过表达her2的乳腺癌细胞凋亡。基于证据的互补和替代医学。2012年,952504年
  48. 陈辰,杰文元,林林,吉民李,顺宏黄,京毅陈,京义吴,程冠,慈溪林吴,莹千湖,You-Hsuan Chen,Chiao-yuan粉,平春黄,清华法,平清河村,春川钊和洪林陈*(2011)蛋白酶诱导胰腺癌细胞抗药性抗药性分析.分子生物系统。7,3065-3074
  49. 陈怡文,陈光志,陈秀川,吕平江,吕颖杰,李颖雷,吴成涛,陈洪林*(2011)血浆蛋白质组学分析在糖尿病患者血液透析中临界肢体缺血的作用。分子生物系统.7,1990-1998。
  50. 陈怡文,周秀川,吕平江,尹显生,黄方良,Wun-Shaing韦恩常,嘉源粉丝,I-Fan Tu,Tzu-Chia Lai,Szu-Ting Lin,莹千楼陆,千豪武,顺宏黄和洪林陈(2011)线粒体蛋白质组学分析瘤瘤和转移的线粒体蛋白质组学分析乳腺癌标记。功能和整合基因组学。11日,225 - 239。
  51. Peir-Haur洪,莹千河陆,陈y辰,春川围,平清山,莹赤李和洪林陈(2010)2型糖尿病肾病血浆鉴定蛋白质组学鉴定。综合组学杂志。1,151-156。
  52. Jenny Worthington, Mariana Bertani, Hong-Lin Chan, Bertran Gerrits and John F Timms(2010)乳腺管腔上皮细胞中ErbB信号的转录分析——通过IGFBP3调控ErbB和IGF1信号的相互作用。BMC癌症10日,490年。
  53. 黄香玲,邢湘伟,赖子嘉,陈宜文,李天仁,陈新祖,吕平江,吴杰琳,吕英杰,林思婷,林正文,赖志浩,张浩登,周秀传,陈洪林*(2010)胰蛋白酶诱导的哺乳动物细胞传代培养的蛋白质组改变。生物医学科学杂志。17 (1)36.
  54. Hsiu-Chuan Chou,Yi-Wen Chen,Tian-Ren Lee,Hsin-Hsin Shen,Hsin-Hsin Shen,Ping-Chiang Lyu,John F. Timms和Hong-Lin Chan *(2010)蛋白质组学研究ROS的角色研究H9C2细胞的SRC激酶抑制剂:心脏缺血再灌注损伤研究的模型细胞。自由基生物学与医学。4996-108
  55. 乃文个展Chang Chih-Ho Lai Chin-Fen Lin Chia-Der林,林Ying-Ju, Lei Wan,吉姆Jinn-Chyuan功能Shih-Yin Chen张揖平黄Yu-Ting唱歌,Tse-Wen道,Cheng-Kuo Lai Ming-Hsui蔡,红菱Chan Yu-Jen周素卿、单音词林(2010)Proteomics-based结合珠蛋白的识别作为一种新的等离子体生物标志物在口腔鳞状细胞癌。我们共同Chimica学报411.984 - 991
  56. Chan,H.L.,TIMMS,J.F.(2010)使用半胱氨酸标记二维差凝胶电泳的氧化还原变化的蛋白质组学分析。分子生物学的方法在出版社。
  57. 赖子嘉,周秀川,陈义文,李天仁,陈新祖,沈新新,李维达,陈洪林*(2010)利用二维差异凝胶电泳技术分析潜在乳腺癌标志物的分泌和蛋白质组学。蛋白质组研究杂志91302 - 1322
  58. Chan, H.L., Chou, H.C., Duran, M.C.,Gruenewald, J., Waterfield, m.d., Ridley, A. and Timms, J.F. (2010) EGFR和SRC激酶在促进氧化应激依赖性上皮细胞粘附丢失和凋亡中的主要作用。生物化学杂志2854307 - 4318。
  59. George, R., Chan, h.l., Ahmed, Z., Suen, k.m., Stevens, C.N, Levitt, j.a., Suhling, K., Timms, J.F. and Ladbury, J.E.(2009)一个Shc和Ran-GTPase的复合物定位于细胞核。细胞和分子生命科学66711 - 720。
  60. Duran, M.C.,Chan, H.L, Timms, J.F.(2008)通过免疫沉淀和质谱法鉴定氧化应激诱导的酪氨酸磷酸化蛋白。分子生物学的方法527.33-45。
  61. Chan, h.l., Gaffney, P., Waterfield, m.d., Anderle, H., Matthiessen, h.p., Schwarz, h.p., Turecek, p.l., Timms, J.F. (2006) UVC辐照诱导血浆蛋白损伤的蛋白质组学分析:血清淀粉样蛋白P成分作为光解的主要靶点。费用字母580,3229-3236。
  62. Chan, H.L, Gharbi, S, Cramer, R., Gaffney, P., Waterfield, m.d., Timms, J.F.(2005)利用半胱氨酸和赖氨酸标记2D-DIGE对乳腺管腔上皮细胞中氧化还原-和erbb2依赖的变化进行蛋白质组学分析。蛋白质组学5,2908-2926。
  63. White, S.L., Gharbi, S., Bertani, m.f., Chan, H.L., Waterfield, m.d., Timms, J.F.(2004)人乳腺管腔上皮细胞中ErbB-2过表达的细胞反应:mRNA和蛋白表达的比较。布尔。J.癌症90年,173 - 181。

乳腺癌研究与进展杂志