KhawarSohail西迪基
KhawarSohail西迪基
助理教授

生命科学系
法赫德国王石油和矿产大学
沙特阿拉伯

教育类

*伦敦大学帝国理工学院,英国(18-07-1990)

传记

在英国帝国理工学院(Imperial College for Science, Technology and Medicine)获得酶生物技术和蛋白质化学博士学位,导师为Brian S Hartley, FRS教授,之后加入费萨拉巴德国家生物技术和基因工程研究所(NIBGE)。除了教授哲学硕士(生物技术)课程外,他还从事木聚糖和纤维素降解的酶学研究。在2001年,他加入了生物技术和生物分子科学学院,新南威尔士大学,悉尼,澳大利亚,他致力于protein-structure-function-stability extremophilic和基因分析和化学修饰蛋白质和酶生物技术使用各种工具,包括色谱法,电泳、生物热分析(iTC、DSC)、荧光和CD光谱、质谱分析等。他目前就职于沙特阿拉伯达兰市法赫德国王石油与矿产大学生命科学系。


研究的兴趣

  1. 蛋白质结构功能稳定性关系
  2. 具有生物技术重要性的酶的动力学、生物化学、生物物理和热力学特性。
  3. 极端亲和多极端亲酶
  4. 对酶进行化学/遗传修饰以提高其催化性能。
  5. 蛋白质分析的生物物理工具(生物热法、荧光光谱法、圆二色谱法、电泳法、色谱法等)
  6. 蛋白质分析的生物信息学工具
  7. 酶生物技术(分离、表征和应用)
  8. 磁性酶与酶循环
  9. 了解蛋白质稳定性和延长酶活性

专业的活动:

技术和个人技能:

  1. 使用荧光光谱法、圆二色谱法(CD)和紫外-可见分光光度法、量热法、质谱法、蛋白质电泳、比色法和量热酶分析等技术对生物大分子进行结构分析
  2. 利用柱色谱法从真菌、细菌和植物中纯化蛋白质
  3. 与其他专家组合作用于蛋白质结构研究的技术包括质谱、小角度X射线散射(SAXS)和X射线结晶学
  4. 研究生的监督/共同监督,蛋白质化学和酶技术实验室和设备的管理,培训学生和同事。
  5. 设计和进行实验,分析数据,撰写论文,资助有关酶工业应用的申请。
  6. 优秀的书面和口头沟通能力,包括研讨会、讲座、论文/评论写作。
  7. 团队合作,友好,喜欢合作研究
  8. 精通IT,精通Microsoft Office、数据分析软件(Origin、SigmaPlot、酶动力学)和生物信息学工具。
  9. 完成辐射安全培训、有害物质、绿色实验室环境合规性、实验室安全意识-员工、研究主管职业健康安全课程,并参加新南威尔士州提供的职业健康安全意识在线课程。

出版物

  1. 西迪基2015.酶的抗活性-稳定性权衡:利用熵提高活性和热稳定性(生物技术标准修订版出版)。
  2. 西迪基2015.有些人喜欢热的,有些人喜欢冷的:温度依赖的生物技术应用和嗜极酶的改进。Biotechnol。已出版(DOI: 10.1016/j.biotechadv.2015.11.001)。
  3. Guerriero G, Hausman J- f, Strauss J, Ertan H西迪基(2015)木质纤维素生物质:生物合成、降解和工业利用。工程。生命科学(新闻界)
  4. 埃尔坦H、卡塞尔C、维尔玛A、波尔贾克A、查尔顿T、奥尔德里希·赖特J、奥马尔SM、,西迪基和Cavicchioli R(2015)一种新的广泛特异性碱性金属蛋白酶假单胞菌从冷藏牛奶中分离出来的:钙在提高酶产率中的作用Catal j·摩尔。B:酶113:1-8
  5. Guerriero G, Hausman J- f, Strauss J, Ertan H西迪基(2015)破坏植物生物量:关注真菌和极端微生物细胞壁水解酶。植物科学。234:180-193
  6. 西迪基,Ertan H,Charlton T,Poljak A,Dawood Khaled AK,Yang X,Marshall G和CavicchioliR(2014)腐殖物质的多功能过氧化物酶降解:使用等温滴定量热法评估动力学,并应用于工业废物。J.生物技术公司。178:1-11.
  7. Najnin T,西迪基,Curmi PM,Cavicchioli R 2014。南极产甲烷菌温度响应双组分调节系统的特征,布氏甲烷藻。蛋白质学会第28届年度研讨会,加利福尼亚州圣地亚哥,2014年7月27日至30日。蛋白质科学, 23:109-110.
  8. Das T、Sehar S、Koop L、Wong YK、Ahmed S、,西迪基,Manefield M(2014)钙对细胞外DNA介导的细菌聚集和生物膜形成的影响。PLoS One(9:e91935.doi:10.1371/journal.pone.0091935)
  9. 西迪基和Cavicchioli R(2006)冷适应酶。生物化学年鉴.卷。75:403 - 433。
  10. 卡维奇奥利R,西迪基, Sowers KR和Andrews D(2002)低温极端微生物及其应用。生物技术的现状. 13: 253-261.
  11. 卡维奇奥利R、查尔顿T、埃尔坦H、奥马尔SM、,西迪基Williams TJ(2011)从嗜冷菌中提取酶的生物技术应用。微生物生物技术4:449 - 460。
  12. 西迪基,Williams TJ,Wilkins D,Yau S,Allen MA,Brown MW,Lauro FM和Cavicchioli R(2013)嗜冷菌。地球和行星科学年度回顾。第41卷:87-115。
  13. 二滩,,西迪基,KSMuenchhoff J, Charlton T, Cavicchioli R(2012)利用等温滴定量热法对混合多功能过氧化物酶功能特性的动力学和热力学表征:锰过氧化物酶激活和木质素过氧化物酶抑制的深入研究Biochimie94:1221 - 1231。
  14. Julia Muenchhoff J,西迪基, Neilan BA(2012)鉴定了原核生物l -精氨酸严格的底物特异性和活性位点稳定性所必需的两个残基:glycineamidinotransferaseCyrA。FEBS279:805 - 815。
  15. Pilak O, Harrop SJ,西迪基,Chong K,De Francisci D,Burg D,Williams TJ,Cavicchioli R,Curmi PM 2011南极古宙的伴侣主要是单体:开放态单体的晶体结构。环境Microbiol13:2232-2249.
  16. Muenchhoff J西迪基KSPoljak一个,阿布乔丹巴罗KDNeilan BA(2010)一种新型的原核l -精氨酸:甘氨酸脒转移酶参与了圆筒精子素的生物合成,FEBS J277(18): 3844 - 3860。
  17. De Francisci D, Campanaro S, Kornfeld G,西迪基, Williams TJ, Ertan H, Treu L, Pilak O, Lauro FM, Harrop SJ, Curmi PM, Cavicchioli R(2010)来自南极太古代的RNA聚合酶亚基E/F布氏甲烷球菌结合特定种类的mRNA。包围微生物学。13:2039 - 2055。
  18. 西迪基,Poljak A,De Francisci D,Guerriero G,Pilak O,Burg D,Raftery MJ,Parkin DM,Trewhella J,Cavicchioli R(2010)一种具有熔融球状状态的化学修饰α-淀粉酶具有熵驱动增强的热稳定性。蛋白质工程23(10):769-780.
  19. 西迪基, Parkin DM, Curmi PM, De Francisci D, Poljak A, Barrow K, Noble MH, Trewhella J, Cavicchioli R(2009)一种提高低温下蛋白酶催化效率的新方法:通过化学修饰降低底物抑制。生物技术生物工程103(4):676-86.
  20. 马鹏飞、劳罗FM、威廉姆斯TJ、伯格D、,西迪基(2009)嗜冷古宙的基因组序列,布氏甲烷球菌:基因组进化在冷适应中的作用。伊斯梅J3(9):1012-35.
  21. Afzal AJ、Bokhari SA和SiddiquiKS(2007)化学修饰的高活性木聚糖酶的动力学和热力学研究盾叶螨sp:必需氨基的存在。生物化学生物技术.141(2 - 3): 273 - 97。
  22. 西迪基,Poljak A,Guillhaus M,Francisci D,Curmi PMG,Feller G,D'Amico S,Gerday C,Uversky V N和Cavicchioli R(2006)赖氨酸与精氨酸在酶冷适应中的作用:将赖氨酸改性为高精氨酸可稳定来自假交链孢杆菌蛋白质:结构。Func。生物信息学。64 (2): 486 - 501
  23. Giaquinto L,Curmi PMG,西迪基, Poljak A, DeLong E, DasSarma S和Cavicchioli R(2007)。古生菌冷休克蛋白(Csps)的结构与功能细菌学. 189: 5738-5748
  24. 西迪基,Feller G,D'Amico S,Gerday C,Giaquinto L和Cavicchioli R(2005a)活性位点是多结构域冷适应α-淀粉酶展开途径中最不稳定的结构。细菌志。187 (17): 6197-6205
  25. 西迪基, Poljak A, Guilhaus M, Feller G, D’amico S, Gerday C和Cavicchioli R (2005b)二硫桥在冷活性A -淀粉酶活性和稳定性中的作用。细菌.187 (17): 6206 - 6212
  26. 西迪基和Cavicchioli R(2005)提高了冷适应脂肪酶B的热稳定性和活性南极洲假丝酵母然后用氧化多糖进行化学修饰。极端微生物9 (6): 471 - 476
  27. Afzal AJ, Ali S, Latif F, Rajoka MI和西迪基(2005)对来自中国的纯化超活性木聚糖酶的创新动力学和热力学分析盾叶螨服务提供商。应用。生物化学。生物技术.120 (1) 51 - 70
  28. 西迪基,Afzal AJ,Bokhari SA和Singh S(2004)基于Kramers理论的新型热力学关系,用于研究高粘度下的酶动力学。IUBMB生活56 (7): 403 - 407
  29. 西迪基,Poljak A和Cavicchioli R(2004)通过使用四羧基二苯甲酮衍生物对脂肪族或氨基进行化学修饰,提高了嗜冷和中温生物碱性磷酸酶的活性和稳定性。细胞与分子生物学50 (5): 657-667.
  30. 西迪基,Cavicchioli,R.和Thomas,T(2002)耐冷和嗜热古细菌延伸因子2(EF-2)蛋白质的热力学活化性质.极端微生物6: 143 - 150
  31. Bokhari SA、Afzal AJ、Rashid MH、Rajoka MI和西迪基(2002)通过化学修饰将羧甲基纤维素酶的表面羧基与苯胺偶联:水和水溶性有机混合物中的极端热稳定。Biotechnol。进步. 18: 276-281.
  32. 西迪基, NajmusSaqib, AA, Rashid MH和Rajoka MI.(2000)羧基修饰显著改变了纯化的羧甲基纤维素酶的动力学性质黑曲霉酶与微生物技术27, 467-474.
  33. 西迪基, Rangarajan M, Hartley BS, Kitmitto, A, Panico, M, Blench, IP and Morris HR (1993)生物化学J。289年,201 - 208。
  34. 西迪基, Loviny - Anderton T, Rangarajan M和Hartley BS (1993)节细菌属D-木糖异构酶:羧基的化学修饰和pH最佳的蛋白质工程。生物化学J。296(3), 685 - 691。
  35. Afzal AJ、Bokhari SA、Rashid MH、Rajoka MI和西迪基(2000)在高分辨率碱性冷原位天然(HiRACIN)-PAGE和高分辨率原位抑制天然(HiRISIN)-PAGE上检测聚合物降解酶的两种简单快速的方法。生物技术公司.22(11) 957 - 960。
  36. 西迪基,Shemsi AM,Anwar MA,Rashid MH和Rajoka MI(1999)通过化学改性部分和完全改变羧甲基纤维素酶的表面电荷:水溶性有机溶剂中的热稳定。酶。微生物学。技术.24岁,599 - 608。
  37. 拉希德MH和西迪基(1998)羧基修饰:高温活化的电荷中和和电荷反转-葡萄糖苷酶黑曲霉生物技术应用生物化学.27日,231 - 237。
  38. 拉希德MH和西迪基(1998)天然和化学修饰β-葡萄糖苷酶稳定性的热力学和动力学研究黑曲霉生物化学过程. 33(2), 109‑115.
  39. Shemsi AM, Ahmad T, Rashid MH和西迪基(1997)用于从蛋白质中分离非共价连接多糖的隔间电泳装置的自动化。微生物酶。技术。22(1), 76 - 77。
  40. Rashid,MH,Najmussakib AA,Rajoka MI和西迪基(1997)天然酶迁移率转移分析(NEMSA):一种新的方法,用于监测来自微生物的羧甲基纤维素酶的羧基修饰黑曲霉生物技术公司。技巧11:4, 245 - 247。
  41. 西迪基,Najmussakib AA,Rashid MH和Rajoka MI(1997年)从黑曲霉通过羧基修饰。生物技术公司. 19:4, 325‑329.
  42. 西迪基KS,一种简单的、非破坏性的方法从细胞外产生的β -葡萄糖苷酶中分离多糖黑曲霉.酶.微生物.技术.16(10), 912 - 917。
  43. 西迪基K.S(1)羧甲基纤维素酶的活性和热稳定性黑曲霉受到非共价多糖的强烈影响。世界微生物学杂志。生物技术.12(3), 213 - 216。
  44. 拉希德MH和西迪基(1996)细胞外β -葡萄糖苷酶的稳定性黑曲霉非共价连接的多糖显著增强。叶形线Microbiol.41(4), 341 - 346。
  45. 西迪基Rajoka MI和Rashid, MH, Durrani, IS, Ghauri TM的纯化和表征细胞内β -葡萄糖苷酶Cellulomonasbiazotea世界。j . Microbiol。Biotechnol。13日,245 - 247。
  46. 西迪基, Azhar MJ, Rashid MH和Rajoka MI(1997)羧甲基纤维素酶活性位点残基的稳定性和鉴定黑曲霉Cellulomonasbiazotea叶形线Microbiol.42岁,312 - 318。
  47. 西迪基和Ali R(1991),一种敏感且简化的十二烷基硫酸钠蛋白质凝胶染色方法。技巧, 3(4), 187 - 190。

生物分析技术传单